A könyvtár szempontjából lényeges, hogy az értékes dokumentumokat ne lehessen biblioboxon keresztül visszajuttatni; erről az olvasókat megfelelően tájékoztatni kell. Bizonyos dokumentumtípusok pedig sérülékenységük miatt nem alkalmasak a biblioboxos kölcsönzésre (pl. zenei anyagok). Amennyiben a könyvtárhasználó nem tartja be a kölcsönzéssel kapcsolatos szabályokat, a felelősség őt terheli a dokumentumok állapota miatt.
A bibliobox külső felületén jól láthatóan jelezni kell a használók számára, hogy a dobozba történő bedobással a dokumentum még nincs visszavéve: a visszavétel akkor lesz teljes, amikor a könyvtáros a biblioboxból a dokumentumot kiveszi, és az újra a kölcsönző (a könyvtár) birtokába kerül. Munkaszüneti nap esetén ez a következő munkanapon lehetséges. Amíg a könyvtár nem küld automatikus értesítést a használónak arról, hogy a könyvet visszavette, addig az olvasó dolga, hogy meggyőződjön ennek tényéről.
Probléma jelentkezhet akkor, ha az olvasó azt állítja, hogy a könyvet a biblioboxba bedobta, de a könyvtáros azt állítja, hogy ott nem volt. Az olvasó hárítja a térítési kötelezettségét, amelyet a könyvtár számon kér rajta. Amennyiben a felek a kérdésben nem tudnak megegyezésre jutni, polgári peres útra terelhetik annak megoldását. A polgári jog negatív bizonyítási elve szerint a "nemlétezés bizonyíthatatlan", ezért az olvasót terheli annak bizonyítása, hogy valóban bedobta a könyvet a szerkezetbe.
A bibliobox a nap 24 órájában a használók rendelkezésére áll, kényelmüket szolgálja szombaton, vasárnap és ünnepnapokon is. A megfelelő kontroll érdekében, a vitás esetek elkerülése végett ajánlott a biblioboxok kamerás megfigyelése. Ez azonban újabb, a személyes adatokról szóló jogszabályokat sérthet, amelyek tárgyalása önálló fejezetet kíván. (A bibliobox jogi vonatkozásai; ref.: Prókai M.)